Приказ Тюменского геологического управления о создании Мегионской нефтеразведочной экспедиции вышел в январе 1962 года.
Экспедиция была создана на базе на базе ликвидированной Нижневартовской партии глубокого бурения в связи с увеличением объёмов работ в районе Мегионского нефтяного месторождения. Начальником МНРЭ был назначен Михаил Владимирович Шалавин, но уже через полгода его сменил на этом посту Владимир Алексеевич Абазаров, который возглавил Мегионскую нефтеразведочную экспедицию летом 1962 года.
Первоочередной задачей начальник экспедиции поставил наращивание темпов разведки и подготовки запасов нефти, прежде всего, на Мегионском месторождении, тем более что Главное геологическое управление существенно помогало в этом. Баржи с грузами шли одна за другой.
Для обустройства экспедиции в Мегионе было создано строительно-монтажное управление. Началось ускоренное строительство производственной базы с мастерскими, кузницей, котельной, электростанцией, гаражом.
Были созданы цеха и участки: вышкостроение возглавил практик монтажа буровых Василий Сергеевич Васякин, начальником цеха бурения стал молодой, энергичный Владимир Иосифович Коломасов, которого через год выдвинули на должность главного инженера экспедиции. Начальником геологического отдела был назначен горный инженер-геолог Генрих Павлович Худорожков, геофизическую партию возглавил Павел Маркович Клочан, руководство транспортным цехом доверили опытному водителю Александру Семёновичу Зарубину, механический участок - Михаилу Алексеевичу Кузьменкину. Своим заместителем по общим вопросам Абазаров назначил Петра Ильича Печёрина, начальником отдела кадров - Николая Дмитриевича Гузя, который в последующие годы бессменно возглавлял профком экспедиции.
Объёмы работ нарастали шквально, экспедиция росла не по дням, а по часам, и уже к лету 1963-го года вышла в число лучших предприятий Тюменской геологии с объёмом более 30 тысяч метров бурения в год. Таких темпов роста объёмов в течение одного года в Тюмени ещё не знали. В том же году Мегионская экспедиция ведёт подготовку Мегионской площади к промышленной эксплуатации по временной схеме.
4 июня 1964 года состоялась отправка первой мегионской нефти на Омский нефтеперерабатывающий завод, а 1 августа 1964 году было создано НПУ «Мегионнефть». В том же году в Мегионе появилась своя больница, аптека и свой участковый милиционер.
В 1963-1967 годах мегионские геологи под руководством Абазарова открывали одно за другим месторождения: Ватинское, Северо-Покурское, Аганское, Нижневартовское... Когда в 1965 году было открыто уникальное Самотлорское месторождение, основные силы мегионской экспедиции были направлены на его ускоренную разведку. Ежегодный прирост геологических запасов нефти превышал один миллион тонн. В 1967 году было открыто крупное нефтегазовое месторождение Варьёганское. Руководимая Абазаровым экспедиция неоднократно отмечалась в числе лучших и удостаивалась различных почестей и наград. В 1972 году за открытие Самотлора и большие достижения в разведке недр Среднего Приобья Мегионская экспедиция была награждена орденом «Знак Почёта». В 1978 году на основе Мегионской, Аганской и Вахской нефтеразведочных экспедиций, а также Мегионской вышкомонтажной конторы и Мегионской экспедиционно-комплектовочной базы было создано производственное объединение по разведке нефти и газа «Мегионнефтегазгеология».
В последующие годы «взлётов» и «падений», многочисленных реорганизаций геологического объединения МНРЭ всегда была и по сей день остаётся основным предприятием мегионских геологов.
За годы существования МНРЭ на посту начальника экспедиции побывало 15 руководителей. После В.А. Абазарова в разные годы её возглавляли С. Л. Каталкин (он, как и Абазаров, был на этом посту дважды), Г. Б. Рогожников, В.А. Гавриков, С. В. Бурдин, Б. С. Хохряков, В. А. Макар, В. А. Бурко, Б. П. Чащин, Ю. Р. Андреев, Н. Е. Перепелюк - Кучеров, А. А. Семянов, А. А. Нугуманов. С 2004 года и по настоящее время Мегионской экспедицией руководит Михаил Львович Мушак.
Пресс-служба Роснедр